Veelvuldig antibioticagebruik heeft een groot nadeel: bacteriën worden ongevoelig voor de werking van een of meerdere antibioticasoorten. Dit heet antibiotica-resistentie. Infecties zijn dan moeilijk te behandelen.
Antibiotica-resistentie kan ook ontstaan als antibiotica niet precies volgens het voorschrift worden ingenomen.
Iedereen kan resistente bacteriën oplopen én ze verspreiden. Vaak wordt u daar niet ziek van en verdwijnen de bacteriën vanzelf weer. Maar mensen met een verminderde weerstand lopen een grotere kans er wel een infectie van te krijgen.
Als een bacterie ongevoelig is voor een groot aantal antibiotica wordt dat multiresistent genoemd. Een bekend voorbeeld daarvan is de MRSA-bacterie.